آیت الله اعرافی نامزد انتخابات میان‌دوره‌ای مجلس خبرگان با اشاره به شایعاتی مبنی بر اینکه وی رئیس قوه قضائیه خواهد شد در ادامه گفت: موضوع ریاست بنده بر قوه قضائیه را تکذیب می‌کنم. من در هرجایی که رفتم اعلام کرده ام که هیچ اتفاقی قرار نیست در این باره برای من رخ دهد.
قرار گرفتن نام و عکس آیت‌الله اعرافی که علاوه بر مدیریت عالی حوزه، نماینده طیف انقلابی هم به شمار می رود، در کنار نام و عکس دو نفر از اساتیدی که هم از نظر گرایش سیاسی و هم از نظر رویکرد علمی و نظری، در طیف نواندیش حوزه دسته بندی می شوند، از همان ابتدا تعجب برانگیز و از سویی خوشحال کننده بود.
آیت‌الله اعرافی در پیامی با دعوت از مردم برای حضور پرشکوه در انتخابات تصریح کرد: حوزه‌های علمیه در کنار مردم شریف و جوانان رشید بر عزم خویش در همراهی مردم و شرکت در انتخابات استوار خواهد بود.